Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPCS3P61009 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms