Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELLP55199 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ELLP55199 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ELLP55199 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms