Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms