Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDGFP51858 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDGFP51858 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDGFP51858 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms