Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSR4P51571 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms