Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF6P49848 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF6P49848 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms