Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPAP49450 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPAP49450 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPAP49450 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPAP49450 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPAP49450 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPAP49450 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPAP49450 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPAP49450 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms