Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRXP46100 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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