Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms