Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPDP35247 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms