Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms