Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRMP28827 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms