Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms