Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PDE6GP18545 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PDE6GP18545 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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