Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBTFP17480 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBTFP17480 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBTFP17480 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBTFP17480 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBTFP17480 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBTFP17480 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBTFP17480 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBTFP17480 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms