Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HPGDP15428 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HPGDP15428 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms