Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DOBP13765 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DOBP13765 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms