Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC2BP0DI82 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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