Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms