Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGAVP06756 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms