Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CXCL13O43927 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CXCL13O43927 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CXCL13O43927 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CXCL13O43927 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CXCL13O43927 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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CXCL13O43927 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CXCL13O43927 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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