Protein–RNA interactions for Protein: O43745

CHP2, Calcineurin B homologous protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP2O43745 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP2O43745 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHP2O43745 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms