Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

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Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PROM1O43490 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROM1O43490 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROM1O43490 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROM1O43490 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROM1O43490 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROM1O43490 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROM1O43490 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROM1O43490 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PROM1O43490 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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