Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCAO15360 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCAO15360 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCAO15360 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCAO15360 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms