Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf98E9PRG8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms