Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms