Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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