Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TTF2Q9UNY4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms