Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDRG4Q9ULP0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDRG4Q9ULP0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms