Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFDP1Q9UEE9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms