Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPAQ9P0L0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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