Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms