Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLN6Q9NWW5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLN6Q9NWW5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms