Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX15Q9NRS6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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