Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NRIP3Q9NQ35 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms