Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFGAP3Q9NP61 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms