Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM60AQ9NP50 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms