Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-5Q9HDB9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-5Q9HDB9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms