Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms