Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NLRP1Q9C000 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms