Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms