Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CARD11Q9BXL7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARD11Q9BXL7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms