Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOL6Q9BWW8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOL6Q9BWW8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms