Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIRIP3Q9BW71 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms