Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NICN1Q9BSH3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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