Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SPOCK3Q9BQ16 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SPOCK3Q9BQ16 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPOCK3Q9BQ16 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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