Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms