Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGAM5Q96HS1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PGAM5Q96HS1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PGAM5Q96HS1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGAM5Q96HS1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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