Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA3Q96EY1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms