Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM12Q96EX1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms